Ch 7 量 狀 狀 例 拉 拉 力 BbEe 狀 ( ) 數 念 量 念 數 理 來 量 狀 P 量 狀 量 狀 連 數量 狀 狀 ( ) 量 ( 數量 ) (quantitative genetics) 量 狀 量 率 P
量 量 糖尿 量 狀 累 ( 累 ) ( ) 狀 3 9s-93s 歷 論 Fisher, Wright and Haldane 來說 連 異 ( 類 ) 律 參 Genetics Analysis & Principle 3ed Robert J Brooker Ch 5 Quantitative Genetics Table 5 Type of Quantitative traits Fig 53 Fig 54 不連 連 Fig 56 DTT 率 p76-77
P P= +G+E P= 狀 = 狀 G= 狀 E= 狀 狀 類 3
Table 5 Type of quantitative traits 理 行 P 錄 量 狀 狀 不 量 了 數 不 4
不 ( ) ( ) ( ) 不 數 離 ( deviation from the population mean) P 離 例 A 離 5, 6, 7 kg B 離 55, 65, 9 kg (5+6+7+55+65+9)/6=65-5 -5 5-5 Ans: (7 kg) (65, 9 kg) (5+6+7)/3=6 (55+ 65+9)/3=7 離 離 -,, 離 離 -5, -5, Ans: (6, 7 kg) (9 kg) 5
E+7 lb =5 lb G=+3 lb G=- G=+3 lb E=-4lb E=-8 lb (a) P=6 lb (b) P=45 lb (c) P=45 lb Fig 7 離 : 錄 (contribution) 錄 P G E 數 (value) 例 7 ( 數 ) 數 狀 數 例 數 狀 狀 ( 不 狀 ) G E 離 來 零 G = E = p3-4 6
G E 立 不 歷 例 離 了 不 離 立 了 數 不 不 例泌 力 料 力 練 7
p4 (Breeding Value) 狀 留 (breeding value, BV) P G E (parental value) 量 狀 P = u + G + E σ = σ + P σ σ = σ + σ G E 更 句 說 8
= 異 例 B p 5 B B B b B b ( 量 狀 狀 ) 立 (independent gene effect) 9
p 5 立 ( ) ( ) 立 量 來 B 立 不 了 立 不
狀 立 例 狀 了 B B (BB Bb bb) : BV BB = + = g BV Bb = + (-) = g BV bb = - + (-) = -g BB B bb b
Bb 兩 B 了 b 狀 ( ) (Breeding Value) 來 立
來理 異 量 料 (estimated breeding value) EBV 3
異 (Progeny Difference) " 立 狀 立 異 (Progeny difference PD) 力 (transmitting abillty, TA) 兩 PD=/BV 異 p9 P 4
P- (Breeding Value and Selection) 了 來 率 ( 異 ) 不 料 說 料 5
p (GENE COMBINATION VALUE) (gene comnbination value, GCV) 狀 (gene combination effects) 數 裂 離 立 留 來 不 不 G=BV+GCV 例 立 T 數 數 立 T + t - T t 6
立 例 p- 來 不 累 來 7
p- 累 (nonadditive gene effect) 累 (nonadditive genetic value) 累 (nonadditive value) 念 累 累 p 8
(A New Model) 量 狀 (BV) (GCV) 數 : P=u+BV+GCV+E E+7 lb =5 lb G=+3 lb G=- G=+3 lb E=-4lb E=-8 lb (a) P=6 lb (b) P=45 lb (c) P=45 lb Fig 74 9
力 (Producing Ability, PA) 狀 (repeated traits) 量 量 離 力 力 狀 力 了 力 泌 力 permanent environment effects, E p 料 率 泌 力 temporary environment effects, E t P=u+G+E p + E t P=u+BV+GCV+E p + E t P = u + MPPA 力 (most probable producing abilities)
力 來 ( 量 ) 力 (EBVs EPDs) 來 MPPA 來 例 量 狀 狀 76 狀 (liability) 例 力 來 量 例 連 落 ( 例 T 識 ) 落
狀 連 例 量 狀 狀 例 易了 連 例 來 狀 EBVs EPDs MPPAs P=G+E P= +G+E P= +BV+GCV+E P= +G+E p +E t P= + +BV+GCV+Ep+Et PA= + +BV+GCV+Ep
, 4, 5, 6 =4 離 -3+ ++= (-3) +() +() +() =4 4 SD = 4 SD SD = σ = Variance variation ( xi µ ) σ = N 4 量 ( 異 ) Y= u + year + area + e y, a, e 3x+5y= x = 4x+5y= y = -/5 3x+5y+z= 4x+3y-z= x-y+z=4 3 4 5 x 3 = y z 4 A X Y AX = Y A AX = A Y X = A Y 3
Data 8 G E 35 3 34 7 3 38 5 4 37 7 3 8 9 9 9 6 8 4 Data 35 = 34 = 38 = 37 = µ + µ + µ + µ + + + + + α + α + α 3 + α + β β β β 9 = 6 = µ + µ + + + α + α 3 + β β 3 4
5 ( ) 35 g = + + +e 34 g = + + +e 38 g = + + + +e 3 37 g = + + + +e 4 39 g = + n + + 3 + m +e k 來 狀 I=b x + b x + + b n x n + + = k m n e e e e 39 37 38 34 35 3 3 3 α α α α β β β β µ (General Least Square Method) (BLUP) 累 βˆ αˆ
P=u+G+E P=u+A+(D+I)+E P=u+A+E V P =V G +V E V P =V A +V E H = V V G P h = V V A P 率 p7-73 ( ) 數 β=h ; ( ) 數 β=h ; 數 β=h (i) (ii) 累 3 率 6
Key questions Definition What is the purpose of a mathematical model for quantitative traits? 3 How are genotypic value, breeding value and gene combination value related? What are the differences among them? 4 How are breeding value and progeny difference related? 5 Why are independent gene effects and not gene combination effects transmitted from parent to offspring? 6 What is additive gene effects? what is nonadditive gene effects? 7 What is wrong with the notion of additive and nonadditive genes? 8 Why is gene combination value more important to commercial producers than to seedstock producers? 9 What are the repeated traits? 7