中文生物医学文献数据库检索

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1 中文文摘数据库检索 (SINOMED) 北京大学医学图书馆信息咨询部

2 主要内容 1. 系统概况 2. 检索方法和技巧 3. 检索结果的处理 4. 检索实习

3 文摘库 VS 全文库 名称 类型起始时间医学期刊更新 SinoMed 文摘 1978 年 > 1600 种 1-2 月 重庆维普全文 万方数据全文 1994 年 < 1300 种 2-6 月 1999 年 < 1300 种 2-6 月 CNKI 全文 1915 年 < 1300 种 1-2 月 文献数据全, 年代广, 更新速度较快 检索效率高 注意 : 全文库 CNKI 大多数期刊的更新频率要超过 SinoMed

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5 1. 系统概况 研制单位 : 该系统中国医学科学院医学信息研究所 / 图书馆开发研制 整合了中国生物医学文献数据库 (CBM) 西文生物医学文献数据库 (WBM) 北京协和医学院博硕学位论文库等 8 种资源 检索 个性化定题服务 全文传递服务

6 1. 系统概况 内容覆盖 : 中国生物医学文献数据库 (CBM) 西文生物医学文献数据库 (WBM) 日文生物医学文献数据库 俄文生物医学文献数据库 英文文集汇编文摘数据库 英文会议文摘数据库 北京协和医学院博硕学位论文数据库 中国医学科普文献数据库

7 1. 系统概况 整合数据库介绍 (1) 中国生物医学文献数据库 (CBM) 收录范围 : 收录 1978 以来 2000 余种中国生物医学期刊, 以及汇编 会议论文的文献题录, 数据每月更新, 全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理 截止到 2016 年 2 月, 收录文献 910 多万篇 年增文献 50 余万篇 学科范围 : 涉及基础医学 临床医学 预防医学 药学 中医学及中药学等生物医学的各个领域

8 1. 系统概况 整合数据库介绍 (2) 北京协和医学院博硕学位论文库 收录范围 :1981 年以来协和医学院培养的博士 硕士研究生学位论文, 学科范围涉及医学 药学各专业领域及其他相关专业, 内容前沿 丰富, 可在线浏览全文 每季更新 截止到 2016 年 2 月, 收录论文一万余篇

9 1. 系统概况 整合数据库介绍 (3) 中国医学科普文献数据库 收录范围 : 收录 2000 年以来国内出版的医学科普期刊近百种, 重点突显养生保健 心理健康 生殖健康 运动健身 医学美容 婚姻家庭 食品营养等与医学健康有关的内容 每月更新 截止到 2016 年 2 月, 文献总量 32 万余篇

10 2. 检索技巧和方法 基本检索 主题检索 分类检索 期刊检索 作者检索 机构检索 基金检索 引文检索 我的空间 检索历史

11 2.1 基本检索 跨库检索 : 逻辑组配检索 : AND ( 逻辑与 ) OR ( 逻辑或 ) NOT ( 逻辑非 ) A B A B A B 二次检索 在已有检索结果的基础上再检索, 逐步缩小检索范围

12 2.1.1 跨库检索

13 2.1.2 通配符检索 输入 血? 动力 输入 肝炎 % 疫苗 单字通配符 (?):? 替代一个字符 任意通配符 (%): % 替代任意个字符

14 2.1.3 短语检索 输入 "1,25-(OH)2D3" 检索词中含有 - (, 等特殊符号时, 用英文半角双引号 ( )

15 2.1.4 智能检索 自动实现检索词 检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索

16 2.1.5 限定检索

17 2.1.6 高级检索 指定字段检索和表达式构建相结合的检索方式

18 2.1.6 检索举例 年发表的关于美托洛尔治疗高血压的综述文献 1. 限定条件 年 综述 2. 输入关键词 美托洛尔 高血压 环孢素对肝癌的影响 肝癌 and 环孢素 ( 肝癌 or 肝细胞癌 ) and ( 环孢素 or 环孢菌素 ) 肝 % 癌 and 环孢 % 素

19 2.2 主题检索 主题检索是基于文献内容的主题概念进行检索, 有利于提高查全率和查准率 在 SinoMed 中,CBM WBM 中国医学科普文献数据库和北京协和医学院博硕学位论文库均支持主题检索 主题检索的依据 : 美国国立医学图书馆编著的 医学主题词表 ( 即 MeSH 词表 ) 中国中医研究院中医药信息研究所编著的 中医药学主题词表

20 主题词 :( 规范主题词 subject headings) 经系统规范词表控制的统一检索用词 关键词 ( 自由词 ) 主题词 艾滋病 AIDS 爱滋病 获得性免疫缺陷综合征

21 2.2 主题检索 主题索引中提供中 英文两种形式 主题词检索的功能 : 1 提供主题词的定义 注释 ; 2 显示主题词之间的族性关系 ( 上位词 下位词 同位词 ); 3 将非主题词引见到主题词形式

22 2.2 主题检索 副主题词 (subheading): 限定规范主题词某一方面研究内容的规范词 例如 : 诊断 : 诊断, 放射摄影术, 放射性核素成像, 超声诊断等治疗 : 治疗, 药物治疗, 放射治疗, 外科学, 膳食疗法, 康复, 中医治疗相关副主题词等药物作用 : 治疗应用, 副作用, 毒性, 中毒等

23 规范化处理之前 标题 : 艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像表现 著者 : 袁春旺 ; 赵大伟 ; 梁连春 ; 李在村 ; 陈枫 ; 段勇 ; 王微 著者单位 : 首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 文摘 : 目的 : 探讨艾滋病 (AIDS) 并发结核患者在高效抗逆转录病毒治疗 (HAART) 中发生免疫重建炎性综合征 (IRIS) 的临床特征及影像表现 方法 : 回顾分析 4 例 AIDS 并发结核患者在 HAART 中发生 IRIS 的临床及影像资料 结果 : 以上临床及影像表现均具有临时性及白限性特征, 随着抗结核及 HAART 联合治疗的继续, 病情均出现好转 结论 :AIDS 并发结核患者在 HAART 中均有可能发生 IRIS, 影像检查对 IRIS 的早期诊断 病情监测 疗效评价及治疗具有重要的作用 出处 : 中华放射学杂志 2008; 42(2) :

24 规范化处理之后 分类号 : R442.8; R512.91; R52; *R734.2 利用 中国图书馆分类法 医学专业分类表 标题 : 艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像表现 著者 : 袁春旺 ; 赵大伟 ; 梁连春 ; 李在村 ; 陈枫 ; 段勇 ; 王微 著者单位 : 首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 文摘 : 目的 : 探讨艾滋病 (AIDS) 并发结核患者在高效抗逆转录病毒治疗 (HAART) 中发生免疫重建炎性综合征 (IRIS) 的临床特征及影像表现 方法 : 回顾分析 4 例 AIDS 并发结核患者在 HAART 中发生 IRIS 的临床及影像资料 结果 : 以上临床及影像表现均具有临时性及白限性特征, 随着抗结核及 HAART 联合治疗的继续, 病情均出现好转 结论 :AIDS 并发结核患者在 HAART 中均有可能发生 IRIS, 影像检查对 IRIS 的早期诊断 病情监测 疗效评价及治疗具有重要的作用 出处 : 中华放射学杂志 2008; 42(2) : 主题词 : 结核 / 并发症 ; 结核 /* 放射摄影术 ; 获得性免疫缺陷综合征 / 并发症 ; 获得性免疫缺陷综合征 /* 放射摄影术 ; 综合征 ; 回顾性研究 ; 炎症 / 病因学 ; 炎症 /* 放射摄影术 利用主题词表

25 主题词 : 结核 / 并发症 ; 结核 /* 放射摄影术 ; 获得性免疫缺陷综合征 / 并发症 ; 获得性免疫缺陷综合征 /* 放射摄影术 ; 综合征 ; 回顾性研究 ; 炎症 / 病因学 ; 炎症 /* 放射摄影术

26 2.2 主题检索 主题词 / 副主题词组配检索 主题词 : 自然语言的规范化用语 如主题词 获得性免疫缺陷综合征 涵盖了 艾滋病 AIDS 爱滋病 等词语 副主题词 : 用于对主题词的某一特定方面加以限定 如 : 治疗 诊断 药物作用等 主题词 / 副主题词组配检索 如 : 肝 / 药物作用 表明文章讨论药物对肝脏的影响

27 CBMDISC 数据库主题词检索 2.2 主题检索 单主题肾炎的药物治疗甲型肝炎的诊断宫外孕的并发症 复合主题胸腺素治疗肺炎前列腺增生与表皮生长因子的关系 加权检索主要论述某一方面的文献

28 主题词加权检索 2.2 主题检索 - 加权 权, 然后知轻重. 权 是表示重要程度的数值 而所谓 加权检索, 是对参加组配检索的各个标识 ( 检索词 ), 依据检索要求分别给予不同重要程度的数值 这是对检索质量进行控制的有效方法 加权的意义 : 检出文献必须主要论述该检索主题 可提高查准率

29 主题词加权检索 2.2 主题检索 主要论述骨折康复的文献 1. 标题 : 跟骨距下关节内移位骨折的手术治疗与术后康复主题词 : 跟骨 /* 损伤 ; 骨折 /* 外科学 ; 骨折 / 康复 ; 距下关节 /* 损伤 ; 手术后期间 2. 标题 : 膝关节内骨折术后的系统康复训练主题词 : 骨折 /* 康复 ; 骨折 / 外科学 ; 手术后医护 ; 膝损伤 /* 康复 ; 膝损伤 / 外科学 若使用 骨折 /* 外科学 的加权检索就检索不到文献 2 若使用 骨折 /* 康复 的加权检索就检索不到文献 1

30 2.2 主题检索 主题词加权检索 仅对加星号 (*) 主题词 ( 主要概念主题词 ) 检索 非加权检索表示对加星号和非加星号主题词 ( 非主要概念主题词 ) 均进行检索

31 2.2 主题检索 - 扩展 扩展检索 主题词扩展检索 : 对当前主题词及其下位主题词进行检索 副主题词扩展检索 : 对当前副主题词及其下位副主题词进行检索

32 2.2 主题检索 例在 中国生物医学文献数据库 (CBM) 中利用主题途径检索有关 骨关节结核治疗 的文献

33 1 词条中带有 见 字时, 前面的词为主题词的款目词 ( 同义词 ), 后面的词为正式主题词 ; 2 词条中无 见 时, 前后均为主题词 选择恰当的主题词 结核, 骨关节 后, 点击进入该主题词的注释信息显示界面

34 加权检索 : 仅对加星号 (*) 主题词 ( 主要概念主题词 ) 检索 扩展检索 : 对当前主题词及其下位主题词进行检索 副主题词选择窗 副主题词扩展检索 : 对当前副主题词及其下位副主题词进行检索 主题词树状结构本例 结核, 骨关节 有下位词 结核, 脊柱

35 选择 加权检索 扩展检索, 添加组配相应的副主题词 治疗 后, 点击 主题检索 按钮进行文献检索

36 如何寻找适当的主题词? (1) 通过了解的中英文关键词及其同义词整词或片段直接进行查找 ; 仔细阅读主题词的注释信息, 特别注意相关词 上位词及专指词 (2) 可以在基本检索界面找出标题包含某个检索词的文献, 浏览检索结果, 看其对应的标引词是什么, 这个就是您要找的主题词 (3) 为了检索的准确性, 建议尽量使用最专指的主题词进行检索 ; 在未找到最专指主题词时, 建议选择其最邻近的上位词 创伤性休克 先天性髋关节脱位 如何选择恰当的副主题词? (1) 系统会自动列出可与当前主题词组配的所有副主题词 ; (2) 如副主题词后面含有 (+), 则表明该副主题词含有下位副主题词 ; (3) 浏览系统提示的副主题词注释信息

37 主题检索练习 检索有关肾血管性高血压的诊断的文献 肾血管性高血压 诊断 检索有关雷公藤治疗类风湿性关节炎的文献 类风湿性关节炎 雷公藤

38 2.3 分类检索 依据 中国图书馆分类法 医学专业分类表 从文献所属的学科角度进行检索, 有利于提高族性检索 在类名 类号输入框输入学科类名或类号 分类号扩展检索 : 对该类号及其下位类号进行查找 复分组配检索 : 对于可复分的类号, 选择复分组配检索 ( 可选择多个复分号 )

39 2.3 分类检索 例查找关于 婴幼儿麻疹病因 方面的文献

40 分类检索界面, 选择 类名 检索字段并输入检索词 麻疹 类名列表中选择准确类名 小儿麻疹

41 选择复分组配检索 ( 可选择多个复分号 )

42 依据分类树逐级展开, 直至浏览到您所需要的类目 小儿麻疹 后点击进入

43 2.4 期刊检索 目标期刊定位 : 可通过检索入口处选择刊名 出版地 出版单位 期刊主题词或者 ISSN 直接查找期刊 ; 也可通过 期刊分类导航 或 首字母导航 逐级查找浏览期刊 ; 期刊文献查找 : 可以直接指定年 卷期进行浏览 ; 也可以输入欲检索的内容后在指定的年卷期中查找浏览具体文献

44 2.4 期刊检索 例通过 中华医院管理杂志 了解农村医疗机构管理方面的研究进展情况

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46 全面了解某学科主题方面的期刊分布当您初涉某学科领域时, 您可以通过 期刊主题词 检索或 分类导航 来获取涵盖或涉及该学科领域的所有期刊信息 辅助投稿通过期刊信息详细列表, 您可以了解目标期刊的学科主题信息 出版频率 编辑部联系方式等

47 解决期刊更名带来的烦恼如 : 在 北京大学学报 医学版 中查阅有关文献 通过选择 含更名期刊, 您可以方便快捷地检索浏览到该刊及其更名期刊 北京医科大学学报 北京医学院学报 中的文献

48 检索 南方医科大学学报 2006 年第 1 期刊登了那 些论文? 何时由 第一军医大学学报 改成 南方 医科大学学报? 自创刊以来发表的文章数量?

49 2.5 作者检索 在查找文献时, 您可能遇到过这样的困扰 : (1) 如此多的重名, 我怎样才能全而准确地定位到 XXX 机构 XXX 研究员在该领域的研究情况呢? (2) 系统返回的检索结果太多, 但我只想了解他以第一著者身份发表的论文情况, 怎么办?

50 2.5 作者检索 高级检索 作者机构限定检索法 与高级检索相比, 作者机构限定检索 功能的突显优势在于 :1 支持作者精确定位 ;2 能够比较有效地解决 同名著者 同构异名 问题, 提高查准率与查全率

51 2.5 作者检索 例. 在 中国生物医学文献数据库 (CBM) 中查找 中国医学科学院基础医学研究所沈岩教授 以第一著者身份发表的论文情况 高级检索 作者机构限定检索法

52 1. 高级检索 界面, 选择 第一作者 检索入口, 输入 沈岩, 点击 发送到检索框 2. 选择 作者单位 检索入口, 输入 中国医学科学院基础医学研究所, 点击 发送到检索框

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54 作者列表中选择作者 沈岩, 并点击 下一步 按钮

55 作者机构列表中选择该作者所在机构, 然后点击 查找 按钮

56 2.6 机构检索 机构检索是 CBM 新增的功能, 可以了解指定机构及作为第一机构时论文发表情况和被引用情况 查找 山西省儿童医院 发表的文献

57 点击机构名称 命中文献数或勾选机构前面的方框再点击 检索 即可查看该机构的发文情况 ; 点击 第一机构命中文献数 则可查看该机构作为第一作者机构的发文情况

58 2.7 基金检索 基金检索是 CBM 新增的另一项功能, 可帮助用户查找特定基金项目成果发表情况 查找 长江学者奖励计划 发表的文献

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60 2.8 引文检索 引文检索是 CBM 新增的一项重要功能 支持从被引文献题名 主题 作者 / 第一作者 出处 机构 / 第一机构 资助基金等途径查找引文, 帮助您了解感兴趣文献在生物医学领域的引用情况 例 : 检索 年间被引文献主题包含 胃肿瘤 的引文

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62 2.9 我的空间 个人用户 直接使用系统注册时所用的用户名和密码即可登录 我的空间 ; 但 集团用户 下的子用户则需要单独注册后才可登录使用 定题检索 在开展某项课题研究时, 需要及时跟踪国内外在该领域的研究进展, 把握最新研究动态和成果 创建个人数据库来保存感兴趣的检索结果 可以对感兴趣的文献进行保存 管理与再利用

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64 2.10 检索历史 最多允许保存 200 条检索表达式, 按照时间顺序从上到下依次显示检索式, 最新的检索式总在最上方

65 无意义的检索表达式选中后点击 清除检索史 可进行删除 可从中选择一个或多个检索式用逻辑算符 AND OR 或 NOT 组配 根据需求选择一个或多个有意义的检索表达式保存成特定的 检索策略 在 我的空间 中可定期调用该检索策略

66 3. 检索结果的处理 检索结果的分析从不同角度 ( 主题 学科 期刊 作者 时间 地区 ) 对检索出来的文献进行聚类处理 检索结果显示 打印和保存 结果显示格式 : 题录格式 文摘格式 结果输出方式 : 打印 保存和 排序方式 : 年代 作者 期刊 相关度 被引频次 原文索取 :CBM 数据库与维普科技期刊全文数据库链接

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68 核心期刊指被 中文核心期刊要目总览 或者 中国科技期刊引证报告 收录的期刊

69 4. 检索实习 -- 举例 例 1: 腹痛的并发症 检索课题中包含两个主要概念 : 腹痛 并发症 采用主题词途径和基本途径相结合方法进行检索

70 第一步, 输入相应的中文主题词 腹痛 为了不遗漏文献, 主题检索有关设置为 : 主题词扩展 不加权, 组配相应的副主题词 并发症, 并设置为 扩展副主题词 ; 第二步, 在缺省字段中输入 ( 腹痛 OR 腹疼 ) AND 并发症进行基本检索 ; 第三步, 点击 检索历史, 根据尽量不遗漏文献的需要, 在检索框中输入 #1 OR #2; 或者点选相应检索式前的方框, 再点击 OR 按钮, 进行检索

71 例 1: 腹痛的并发症 检索策略 : #1 主题词 ==" 腹痛 /CO/ 全部树 " #2 ( 腹痛 OR 腹疼 )AND 并发症 #3 #1 OR #2

72 一个查新案例 委托人提交查新点 : 本课题基于老年抑郁症最新进展, 以综合医院老年抑郁症为研究对象, 将所有入选患者均给与症状评估及自评量表 (SCL-90) 焦虑自评量表 (SAS) 抑郁自评量表 (SDS) 汉密尔顿量表 (HAMD -17) 汉密尔顿量表 (HRSD-24 ) 简易智能精神状态检查表 (MMSE) 量表评估, 达到对老年期抑郁进行早期识别 整理后查新点 : 使用精神评定量表对老年期抑郁进行早期识别

73 检索策略 : #1 早期诊断 [ 不加权 : 扩展 ] OR 早期识别 OR 早期发现 #2 医院, 综合 [ 不加权 : 扩展 ] OR 综合医院 OR 三 * 甲医院 #3 老年人 [ 不加权 : 扩展 ] OR 老年 OR 老人 OR %" 老年 "%[ 特征词 ] #4 抑郁症 [ 不加权 : 扩展 ] OR 抑郁 #5 精神病状态评定量表 [ 不加权 : 扩展 ] OR 精神 * 量表 OR 自评量表 OR SCL-90 OR 焦虑自评量表 OR SAS OR 抑郁自评量表 OR SDS OR 汉密尔顿量表 OR MMSE

74 4. 检索实习 -- 习题 1. 北京大学第三医院近 5 年发表的文章 ( 北京 % 大学 % 第三 % 医院 ) and ( or ) 比较直接输入 北京大学第三医院 结果有何不同 年发表的有关成年人艾滋病并发肺炎的文献 ( 主题检索 ) 3. 检索有关 新生儿窒息的诊断 的综述文献 ( 主题检索 ) 4. 检索 女贞子治疗老年便秘 的文献 ( 主题检索 ) 5. 检索发表在 2006 至 2012 年的关于 头针治疗老年痴呆 的文献 ( 主题检索结合自由词检索 )

75 总结 一般中文生物医学文献课题的检索过程课题的主题分析和策略制定 检索 CBM 数据库 ( 课题的回溯检索, 了解课题的主要文献 ) 结合现刊和网检文献的阅读, 每半月检索一次 CNKI/ 万方 / 维普 ( 掌握最新文献信息, 定题跟踪检索 ) 课题修正 循环检索 课题完成

76 CBM 的特点小结 主题检索功能强 :CBM 是受控的检索数据库, 具有主题检索功能 它既可对单个主题词加权检索, 也可扩展检索, 还可以选择副主题词进行方面组配, 对查全率和查准率都有一定保证 CBM, 界面友好, 方便操作, 检索途径多, 还可以进行分类途径检索, 还可以进行年限的限制 收录 1978 年以来的文献题录, 可进行课题的回溯检索 CBM 属于浅标引, 用主题词检索途径易造成漏检, 要配合自由词检索