首选科技合作伙伴 公司简介 华大基因科技服务有限公司 ( 简称华大科技, 是全球领先的基因组学研究机构 华大基因旗下的子公司 华大科技的业务涉及生命科学的各个领域, 并专注于创新技术服务产品的研发 我们通过与科研院所 医疗机构和生物技术公司开展广泛的交

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2 华大科技承诺为全球的生物 农业 医药领域的科研人员提供全方位的一站式生物技术产品服务和解决方案, 致力成为您的首选科技合作伙伴!

3 首选科技合作伙伴 公司简介 华大基因科技服务有限公司 ( 简称华大科技, 是全球领先的基因组学研究机构 华大基因旗下的子公司 华大科技的业务涉及生命科学的各个领域, 并专注于创新技术服务产品的研发 我们通过与科研院所 医疗机构和生物技术公司开展广泛的交流与合作, 加速技术开发和研究成果转化为最有效的解决方案, 推动分子育种 医疗健康 环境能源等领域的科学研究 华大科技总部位于中国深圳, 服务网络遍布全球 依托华大基因世界领先的大规模测序 生物信息分析 细胞克隆 健康检测 农业育种等技术平台, 我们致力于为全球从事生命科学研究的科研人员提供高质量的行业领先生物技术外包服务, 为合作伙伴提供最优的解决方案 关注领域 动植物研究 为全球动植物研究领域提供从 DN RN 到蛋白质的多层次研究技术支持和全方位解决方案, 致力于动植物贯穿组学的研究, 竭力提高动植物分子育种效率 推动现代农业的产业发展 人类健康致力于开展人类遗传背景 疾病发病机制等研究, 借助新一代高通量测序平台和蛋白质谱平台, 为生物医学领域专家提供基因组 转录组 表观组 蛋白质组学的多组学贯穿研究策略, 积极推动人类遗传及生物医学的发展 药物研发凭借新一代测序 生物芯片 质谱分析和高性能的生物信息学技术, 建立了蛋白质组学高通量技术平台和专业的研发 信息分析团队, 开发出基于基因组学 转录组学 表观组学和蛋白组学贯穿的多组学研究策略, 并为制药企业和生物技术公司量身打造出一系列全方位的高通量筛选和验证服务 微生物研究凭借高通量测序及蛋白质谱等技术, 从 DN RN 蛋白质等分子水平上对微生物进行阐释, 为全球微生物领域的研究者和机构提供多水平技术支持和全方位解决方案 为工业 农业 医学等领域的微生物研究提供扎实的数据支持与新颖的思路拓展, 为探索微生物进化以及微生物群落提供新的线索和思路 1 2

4 专业测序 卓越服务 产品介绍 Sanger 测序及 Oligo 合成 单个样品测序 Single Sample Sequencing 提供质粒提取 PR 纯化 测序引物设计 DN 序列的基本数据分析, 以及长片段 walking 测序后的序列拼接等生物信息学分析服务 B/Fosmid 末端测序 B/Fosmid End Sequencing 一般均进行双末端测序, 主要用于筛选目的基因和基因组组装的定位与评价 Fosmid 文库构建 Fosmid Library onstruction 可用于全基因组的物理图谱构建 基因功能及表达调控的研究 重要性状基因的图位克隆和基因结构及功能的分析等 克隆 lone 在使用 PR 扩增目的基因片段的过程中, 由于不清楚目的基因序列, 并不能确定是否获得单一的 PR 产物, 要获得的目的片段而需要使用 克隆 Shotgun 文库构建及测序 Shotgun Library onstruction and Sequencing 将目的 DN 用机械剪切的方法随机剪切成合适的小片段, 并与载体连接构建的文库 cdn 文库构建 cdn Library onstruction 广泛应用于 : 发现 SNP; 克隆新基因 ; 基因表达谱分析 ; 挖掘与病害 发育等功能相关的关键基因 ; 开展转基因等功能研究, 以改变某生物的性状 ; 保护濒危珍稀生物资源 ES 测序分析 ES Sequencing 可应用于 : 基因的表达谱分析 发掘 SSR 标记 作为构建分子标记连锁图谱所用的探针 酵母双杂交文库构建 Yeast wo-hybrid Library onstruction 用来研究已知蛋白间的相互作用 寻找在蛋白与蛋白间相互作用中起到关键作用的结构域 寻找与靶蛋白相互作用的新蛋白等 PR 重测序 PR Re-sequencing 通过已知序列设计引物并对已知片段进行扩增测序 在单基因遗传病和复杂疾病的致病基因研究和药物敏感性分析 菌种鉴定等方面均有应用 Oligo 合成 Oligo Synthesis 主要应用于反义寡聚核苷酸, 测序与扩增的引物 DN 杂交 探针 点突变以及全基因合成 基因组学研究 全基因组从头测序 De novo Sequencing 不需要任何参考序列即可对指定物种进行测序, 用生物信息学方法进行拼接 组装, 从而获得物种的全基因组序列图谱 全基因组重测序 Whole enome Resequencing 个体全基因组重测序 : 绘制个体全基因组范围内的变异图谱, 可应用于分子标记开发 突变体检测 核心种质遗传水平比较等群体全基因组重测序 : 检测群体全基因组范围内的变异情况, 可用于进化研究 连锁分析 ( 如 Bin Map: 基于低深度测序的全基因组物理重组图谱构建 ) 关联分析等 基于酶切的简化基因组测序 RD-Seq(Restriction site associated DN) 为有 / 无参考基因组的物种提供以高密度贯穿整个基因组的 与限制性位点相关联的遗传标记 外显子 & 目标区域测序 Exome or arget Region Sequencing 检测个体或群体的区域序列变异情况, 用于进化研究 以及连锁或关联分析等研究, 是寻找如孟德尔遗传病 癌症 代谢综合症 精神分裂症等疾病致病基因和易感基因的高效研究手段 芯片分型 Beadrray enotyping 高通量检测大量的 SNP 位点, 可用于分析人类疾病相关位点与结构变异, 人群进化以及动植物农艺性状相关位点 质谱分型 MassRRY enotyping 以极高的精确性以及灵活度直接检测 SNP 位点, 能够高效地验证候选位点 转录组学研究 快速检测物种特定组织在特定时期的所有 mrn 转录本, 进行基因表达差异分析 代谢通路分析 基因结构优化 可变剪接鉴定 SNP 分析等研究 数字基因表达谱升级版 RN-Seq (Quantification) 对任何有参考基因组序列的物种, 进行单样本 mrn 转录丰度分析及多样本 差异表达基因比较分析数字基因表达谱 Digital ene Expression ag Profiling 对模式动植物或者具有高质量参考基因组序列的物种, 进行单样本 mrn 转录丰度分析及多样本差异表达基因比较分析 小 RN 测序 Small RN Sequencing 转录组测序 RN-Seq (ranscriptome) 全面快速鉴定物种特定组织在特定状态下的所有小 RN 序列, 研究小 RN 的基因表达调控功能 降解组测序 Degradome Sequencing 准确高效地筛选出 mirn 的靶基因, 研究 mirn 及其靶基因的相互作用 表观组学研究 全基因组 Bisulfite 甲基化测序 Whole enome Bisulfite Sequencing 绘制物种单碱基分辨率全基因组甲基化图谱, 揭示物种重要经济性状 农艺性状相关基因甲基化特征 RRBS (Reduced representation bisulfite sequencing) 高性价比 贯穿全基因组的单碱基分辨率的甲基化研究方法 MeDIP-Seq 高效 经济的甲基化研究方法, 用于比较大样本量细胞 组织等样品间的相对甲基化差异, 揭示印记基因 性状相关基因甲基化特征 hip-seq 研究组蛋白修饰 转录因子结合位置对胚胎发育和细胞分化等生命过程中基因表达的调控 生物云计算 蛋白质组学研究 蛋白全谱分析 Proteome Profiling 识别出组织 血液等混合样品中尽可能多的肽段和蛋白组分, 并进行蛋白功能分析 蛋白定量分析 Quantitative Proteomics 对多个样本中的蛋白进行定量比较分析, 寻找差异蛋白, 并通过生物信息分析获得相关蛋白的功能信息 目标蛋白分析 arget Proteomics 有目标地分析检测感兴趣的蛋白在大量样本中的表达量 蛋白修饰分析 Modification Proteomics 鉴定翻译后修饰的蛋白质种类和修饰位点, 并对修饰蛋白进行功能分析, 获得其在信号转导途径中的功能等信息 蛋白鉴定分析 Protein Identification 鉴定单一蛋白样品 ( 二维电泳胶点 ) 中等复杂度样品 ( 一维电泳胶条 IP 复合物等 ) 的蛋白质组分 整合了基因组学领域常用的基础数据和华大基因研究院特有的经验数据, 解决海量数据的收集 存储 传输 安全性和数据分析处理等难题, 为需要使用大量计算资源的用户提供了个性化数据存储和高性能计算服务 发表文章 he draft genome of a diploid cotton ossypium raimondii he genome of flax (Linum usitatissimum) assembled de novo from short shotgun sequence reads. Maize HapMap2 identifies extant variation from a genome in flux extensive recruitment of lineage-specific genes in adaptations ene expression profiling of liver cancer stem cells by RN- PLoS ONE Sequencing he genome of ganderma lucidum provide insights into PLoS ONE triterpense biosynthesis and wood degradation ranscriptome analysis of stem development in the tumourous BM Plant stem mustard Brassica juncea var. tumida sen et Lee by RN Biology sequencing omparative population genomics of maize domestication and improvement Identification of resting and ype I IFN-ctivated Human NK ell mirnomes reveals MicroRN-378 and MicroRN-30e as negative regulators of NK ell cytotoxicity omparative genomics of rhizobia nodulating soybean suggests De novo transcriptomic analysis of an oleaginous microalga: pathway description and gene discovery for production of nextgeneration biofuels characterization of the transcriptome of an ecologically important avian species,the vinous-throated parrotbill paradoxornis webbianus bulomachu(paradoxornithidae; ves) Molecular cloning and characterization of PtrLR3, a gene encoding leucoanthocyanidin reductase from Populus trichocarpa, and its constitutive expression enhances fungal resistance in transgenic plants Nature enetics he Plant Journal Nature enetics Nature enetics he Journal of Immunology PNS BM enomics Journal of Experimental Botany

5 技术平台 华大科技依托先进的测序和检测技术 高效的信息分析能力 丰富的生物资源, 搭建了世界 先进的多技术平台, 可实现从中心法则到结构与功能的贯穿研究, 构建生物技术与信息技术 相融合的网络体系 Illumina HiSeq M 2000 Ion orrent BI3730xl pplied Biosystems SOLiD M 4 System 新一代测序平台 新一代测序平台可满足不同需求的核酸水平研究, 服务产品涵盖动植物 微生物 人及药物研发等多个领域 Illumina HiSeq M 2000 pplied Biosystems SOLiD M 4 System Roche S FLX Platform Ion orrent 拥有成熟的 3730 测序平台和配套的生物信息分析平台 3730 测序平台 3730xl 采用最新的光路系统设计, 结合更优化的试剂组合和全自动化操作流程, 在提高产率 提高数据质量的同时最大限度的降低试剂的消耗 BI3730xl 基因分型平台 通过多种技术, 实现对大量位点的检测 在分析人类疾病相关位点与结构变异, 人群进化以及动植物农艺性状相关位点上有广泛应用 Sequenom MassRRY iplex old Illumina iscan Sequenom MassRRY iplex old 置, 已广泛应用于比较基因组学分析发现突变基因 辅助高 全基因组酶切图谱 (Optical mapping, 简称 OM) 是 B Sciex QRP 5500 Roche S FLX Platform Open rgus Optical Mapping System Illumina iscan 全基因组酶切图谱平台 Bruker Ultrafle Xtreme 基于限制性内切酶图谱的一项技术 它可以快速定位序列位 通量测序的数据组装以及菌株分型 Open rgus Optical Mapping System B SIEX, ripleof Bruker maxis hermo Scientific LQ Orbitrap Velos 蛋白质谱平台 拥有可信的蛋白质组学领域的鉴定 分析平台, 可以实现对动植物 微生物 体液等进行大规模的蛋白质组学研究 应用领域涉及营养学 药学 临床研究 法医毒理学 食品安全分析 环境监测等等 hermo Scientific LQ Orbitrap Velos Bruker maxis B Sciex QRP 5500 Bruker Ultrafle Xtreme Waters Xevo Q-S B SIEX, ripleof 培训服务 计算服务 信息技术平台 大型计算机中心 数据库 Bio loud 咨询服务 服务器搭建服务 拥有多个大型生物信息学超级计算中心及数百名经验丰富的生物信息学专家, 提供服务包括云存储 云计算 数据交付 生物信息培训和咨询等 综合服务

6 技术领先质量保证 持续创新 效率突出 华大科技的业务涉及生命科学的各个领域 我们通过与加州大学伯克利分校 中日友好医院 香港中文大学等国内外 科研院所和医疗机构, 辉瑞 默克等全球领先的医药企业开展广泛的交流与合作, 加速技术开发和研究成果转化为最有效 的解决方案, 推动分子育种 医疗健康 环境能源等领域的科学研究, 为全球从事生命科学研究的科研人员提供高质量的 我们专注于创新研发以提供最有效的科学研究解决方案 在拥有高通量测序能力, 以及人类 动植物及微生物基因组 测序项目经验的同时, 我们也不断地设计并升级软件, 编写算法, 开发产品, 建立一体化体系来满足客户的更高的科学研 究要求 我们也将会与全球科学界分享研究成果, 开展广泛的交流与合作 行业领先生物技术外包服务 依托华大基因世界领先的大规模测序平台和科研实力, 我们具备解决各类大型项目的能力, 可以为合作伙伴提供最合 我们对样品有严格的质量评估 同时, 我们的测序平台已通过 ISO 9001:2008 认证 Illumina Spro 认证 gilent Sure-Select 认证以及 ISO27001 信息安全认证, 并对质量体系不断进行改进, 以保证为合作伙伴提供最优质的 测序数据和强大的数据安全系统 适的技术, 精确的预计完成时间, 以及合理的性价比, 用我们的高效与专业满足科研人员的研究需求 全球战略 波士顿 哥本哈根 武汉 香港 深圳 9 10

7 Sanger 测序及 Oligo 合成基因组学研究转录组学研究表观组学研究蛋白组学研究 生物云计算 联系我们 华大基因科技服务有限公司 华大科技 ( 深圳总部 ) 地址 : 深圳市盐田区北山工业区综合楼 (518083) 电话 : 邮箱 :tech@bgitechsolutions.com 网站 : 美洲华大科技 ( 波士顿 ) 地址 :One Broadway, 14th Floor, ambridge, M 02142, US 电话 : 邮箱 :info@bgiamericas.com 欧洲华大科技 ( 哥本哈根 ) 地址 :Ole Maaløes Vej 3, DK-2200 openhagen N, Denmark 电话 : 邮箱 :bgieurope@genomics.cn 亚太 港澳台华大科技 ( 香港 ) 地址 : 香港新界大埔工业村大富街 16 号电话 : 邮箱 : bgihk.enquiry@genomics.cn 日本华大科技 ( 神户 ) 地址 :Kobe KIME enter BLD.8F, Minatojimaminamimachi, huo-ku, Kobe ity, Hyogo-pref , JPN 电话 : 邮箱 :bgijapan@genomics.cn 本手册仅供客户学习 交流和研究使用, 请勿用于商业用途, 违者必究 版权声明 : 本手册版权属于华大基因科技服务有限公司所有, 未经本公司书面许可, 任何其他个人或组织均不得以任何形式将本手册中的各项内容进行复制 拷贝 编辑或翻译为其他语言 本手册中的所有商标或标志均属于华大基因科技服务有限公司及其提供者所有 印刷日期 :2012 年 9 月 E-OM-RO-BR

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