Microsoft Word - 04 赵永伟.doc
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- 灰 逄
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1 , 19(6): Journal of Fishery Sciences of China 研究论文 DOI: /SP.J , 赵永伟 2, 宋文涛 2, 廖小林 2, 牛余泽 2, 庞仁谊 2, 高峰涛 2, 沙珍霞 陈松林 2 1., ; 2.,, , 摘要 :, (Cynoglossus semilaevis) F 1, F 1, 288, 112 (P<0.05) 242, 21, cm, 4.9 cm, 83.3%; 218, 21, cm, 5.5 cm, 82% QTL : ; ; ; 中图分类号 : Q959 文献标志码 : A 文章编号 : (2012) (Cynoglossus semilaevis),,,,,,,,, [1],, [2],, AFLP [3] [4],,, QTL, Bostein [5],, (Ziphias gladius) (Danio retio) (Cyprinus carpio) (Oncorhynchus mykiss) (Ietalurus Punetaus) (Tilapia) (Oryzias latipes) (Sparus aurata) (Scophthalmus maximus) (Seriola lalandi) (Lates calarifer) (Paralichthys olivaceus) [6 21] 收稿日期 : ; 修订日期 : 基金项目 : ( );. 作者简介 : (1986 ),,. 通信作者 :,,,. chensl@ysfri.ac.cn
2 940 19, Liao [22] 103 AFLP , cm, 8.4 cm;,, PCR PAGE, JoinMap4.0, 288, cm cm, 4.9 cm 5.5 cm,,, F 1, , 8,,, 92, 1.2, DNA DNA, 1% (Pharmacia Biotech Ltd.) DNA, DNA 100 ng/μl, 20 PCR PAGE PCR : DNA genomic DNA 1.0 μl; dntps (2.5 mmol/l) 1.0 μl10 PCR buffer ( Mg 2+ ) 1.5 μl; (10 μmol/l) upstream primer 0.5 μl; (10 μmol/l)downstream primer 0.5 μl; Taq DNA polymerase (5 U/μL) 0.1 μl; ddh 2 O 15.4 μl; 20 μl PCR : 95 4 min 1 ; s, s, s, 32 ; 72 7 min 1 ; 4 PCR DYCZ-20C : V, 150 W, 150 ma 3 h JoinMap4.0 χ 2 1:1,, (P<0.05), CP(cross-pollinating), Locus genot. freq. Exclude selected items, Individual genot. freq., Similarity of individuals (the value>0.95), Similarity of loci (the value=1), Grouping tree Calculate (LOD 3.0) Kosambi (centimorgan, cm),, SSR SSR,, 362, 36.2% 320, 1
3 6 : ~46 47~92 F 1, (, ). Fig. 1 The result of amplification of one pair primer in mapping population Lanes 1 46 and on the two sides are F 1 individuals respectively; parents are on the middle(left, right ), 1~46 47~92 F 1, (, ),, 1, BC AD, F 1 AB AC BD CD 4 19 ( HK HK), 12 (u<0.05), ; 53, 18 ; 71, 16 ; 157, 80 ; (F-382, F-783) SSR, 288, , ~111.9 cm, 5~29 ( 1, 2) sex female male number of linkage groups Tab. 1 total number of markers 表 1 半滑舌鳎遗传连锁图谱的特点 The characterization of Cynoglossus semilaevis genetic linkage map number of markers per group /cm average marker interval Gof/cM observed consensus map length Goa/cM estimated consensus map length / % coverage ,, [23 24], SSR, SSR ( 2), 5~29,, cm, ,,,,, AFLP SNP, 114, 96, 39.7%, 95, 43.5%, (Ictalurus punctatus R.) [25] (Crassostrea gigas T.) [26], (Cynoglossus semilaevis) [22]
4 942 第 19 卷 中国水产科学 记的顺序 [28] 分析引起偏分离现象原因, 可能是 生物的遗传连锁图谱 [29 31] 由于半滑舌鳎性成熟 由实验统计误差 取样的随机性以及隐形致死突 需要 2 年时间, 难以建立高世代或回交家系群体, 变的选择等因素所引起的 因此本研究运用 拟测交 策略, 仅用亲代和 F1 构 3.2 作图群体的选择 建其遗传连锁图谱, 必将加快遗传育种改良的 本实验的亲本材料选择中, 作图群体的父本 进程 为渤海近海野生个体, 母本来自于烟台海阳黄海 3.3 图谱分析及评价 水产有限公司人工养殖的半滑舌鳎, 这种亲本组 Liao 等 [22]用 60 个半滑舌鳎 F1 个体建立了半 合, 有利于增加子代群体之间的遗传差异, 同时 滑舌鳎第一代遗传连锁图谱, 其中包含 103 个 选择家系间亲本间遗传差异性较大的家系作为作 AFLP 标记 33 个微卫星标记和 1 个雌性特异的 图家系, 有利于获得更多的多态性标记和遗传信 标记, 该图谱由 26 个连锁群组成, 图谱总长度为 息量, 从而能有效地提高作图效率 cm, 标记间平均间隔为 8.4 cm, 图谱覆盖 近年来 拟测交 理论 [28] 已广泛用于构建水生 图2 Fig. 2 率为 64.4%; 然而本研究中用了 92 个 F1 个体, 构 半滑舌鳎遗传连锁图谱(待续) Genetic linkage map of Cynoglossus semilaevis(to bo continued)
5 6 : 943 ( ) 2,. (continued)fig. 2 Genetic linkage map of Cynoglossus semilaevis The adjacent marker spacing is displayed on the left in cm Kosambi and SSR markers are shown on the right of each group.
6 , 288 SSR, cm, 4.5 cm, 85.9%,, 2n=42t, 21 [22] 21, SSR, 5~29, 4.9 cm 5.5 cm, SSR,, SSR QTL 20 cm [32],, QTL (Goa) : cm cm, , QTL,,, SSR,, QTL 参考文献 : [1],,,. [J]. :, 2010, 25(2): [2],,,. [J]. 2010, 34(12): [3] Chen S L, Li J, Deng S P, et al. Isolation of female-specific AFLP markers and molecular identification of genetic sex in half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis) [J]. Mar Biotechnol, 2007, 9: [4] Chen S L, Tian Y S, Yang J F, et al. Artificial gynogenesis and sex determination in half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis) [J]. Mar Biotechnol, 2009, 11: [5] Botstein D, White R L, Skolnick M, et al. Constuction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorpisms [J]. Am J Human Genet, 1980, 32: [6] Donald C, Morizot, Susan A, et al. Genetic linkage map of fishes of the genus Xiphophorus [J]. Genetics, 1991, 127: [7] Postlethwait J H, Johnson S L, Midson C N, et al. A genetic linkage map for the zebrafish[j]. Science, 1994, 264: [8] Lisa K, Elizabeth S E, Timothy C, et al. A genetic linkage map for zebrafish: comparative analysis and localization of genes and expressed sequences [J]. Genome Res, 1999, 9(4): [9] Peter D K, Felicia C, Ian G W, et al. Genetic linkage mapping of zebrafish genes and ESTs [J]. Genome Res, 2000, 10: [10] Sun X W, Liang L Q. A genetic linkage map of common carp [J]. J Fish Sci Chin, 2000, 7: 1 5. [11] Takashi S, Roy G. D, Karim G, et al. A microsatellite linkage map of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) characterized by large sex-specific differences in recombination rates[j]. Genetics, 2000, 155: [12] Geoffrey C W, Brian G B, Danny J N et al. A microsatellitebased genetic linkage map for channel catfish(ictalurus punctatus) [J]. Genetics, 2001, 158: [13] Bo Y L, Woo J L, Justin E S, et al. A second-generation genetic linkage map of tilapia (Oreochromis spp.) [J]. Genetics, 2005, 170: [14] Tetsuaki K, Keiko Y, Atsuko S, et al. Genetic linkage map of medaka with polymerase chain reaction length polymorphisms[j]. Gene, 2005, 363: [15] Rafaella F, Bruno L, Matina T, et al. A genetic linkage map of the hermaphrodite teleost fish Sparus aurata [J]. Genetics, 2006, 174: [16] Suquet M, Billard R, Cosson J, et al. Artificial insemination in turbot (Scophthalmus -maximus): determination of the optimal sperm to egg ratio and time of gamete contact [J]. Aquaculture, 1995, 133: [17] Eriko O, Takuya N, Yoshitomo N, et al. Genetic linkage maps of two yellowtails (Seriola quinqueradiata and Seriola lalandi) [J]. Aquaculture, 2005, 244: [18] Chun M W, Felicia F, Grace L, et al. A microsatellite linkage map of barramundi, Lates calcarifer [J]. Genetics, 2007, 175: [19] Matthias S, Frederico H, Shoji F, et al. Microsatellite based genetic linkage map of the cichlid fish, Astatotilapia burtoni (Teleostei): A comparison of genomic architectures among
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AFLP % 1. 1 DNA 5 RAPD DNA 0. 1g % ~ ph 6 10 DNA 9 40μl TE SSR STS 20ng /L
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