SARS-CoV 1-3 RNA HCoV-229E 1 HCoV-OC SARS-CoV 5 [rep] [S] [E] [M] [N] 3 rep 2/3 rep 4 S E M N 1 SARS GenBank 16 2 IBV IBV BCK 4 BCo

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1 * SARS-CoV 2002 Severe Acute Respiratory Syndrome SARS SARS-CoV SARS-CoV 5 S E M N SARS-CoV SARS-CoV IBV TGV IBV E M SARS Severe Acute Respiratory Syndrome 2002 * ,

2 SARS-CoV 1-3 RNA HCoV-229E 1 HCoV-OC SARS-CoV 5 [rep] [S] [E] [M] [N] 3 rep 2/3 rep 4 S E M N 1 SARS GenBank 16 2 IBV IBV BCK 4 BCoV BCoV Q BCoV ENT BCoV LUN 1 HCoV 229E 4 MHV MHV2 MHV Penn 97 1 MHV ML10 1 PEDV 1 TGV SARS 3 SARS Urbani SARS CUHK W1 SARS canada 1 ClustalX(V1.8) 4 2

3 Bootstrap Neighbor Joining method Tree-Explore 5 S E M N SARS 3

4 1 SARS GenBank ACCESSION bp 01 AJ IBV BCK Avian infectious bronchitis virus (strain Beaudette CK) complete genomic RNA. 02 NC_ IBV Avian infectious bronchitis virus, complete genome. 03 AF BCoV Q Bovine coronavirus strain Quebec, complete genome. 04 AF BCoV ENT Bovine coronavirus isolate BCoV-ENT, complete genome. 05 AF BCoV LUN Bovine coronavirus isolate BCoV-LUN, complete genome. 06 NC_ BCoV Bovine coronavirus, complete genome. 07 NC_ HCoV 229E Human coronavirus 229E, complete genome. 08 AF MHV Murine hepatitis virus strain 2, complete genome. 09 AF MHV Penn Murine hepatitis virus strain Penn 97-1, complete genome. 10 AF MHV ML Murine hepatitis virus strain ML-10, complete genome. 11 NC_ MHV Murine hepatitis virus, complete genome. 12 NC_ PEDV Porcine epidemic diarrhea virus, complete genome. 13 NC_ TGV Transmissible gastroenteritis virus, complete genome. 14 AY SARS CUHK W SARS coronavirus CUHK-W1, complete genome. 15 AY SARS Urbani SARS coronavirus Urbani, complete genome. 16 NC_ SARS canada SARS coronavirus, complete genome. 4

5 1. SARS-CoV (a) (b) 1 (a) SARS-CoV (b) SARS-CoV 5

6 SARS-CoV 13 1-a 2 BCoV MHV 1 HCoV-229E PEDV TGV 3 IBV SARS-CoV 1-b SARS-CoV IBV 2. SARS-CoV SARS-CoV 5 SARS-CoV 2 (a1) 6

7 (a2) (b1) 7

8 (b2) (c1) 8

9 (c2) (d1) 9

10 (d2) (e1) 10

11 (e2) 2 5 a b c d e rep S E M N 1 SARS-CoV 2 SARS-CoV 11

12 rep S E M N N 1 SARS-CoV rep S E M N S M SARS-CoV IBV E SARS-CoV TGV N TGV SARS-CoV SARS-CoV TGV SARS-CoV N rep 5 SARS-CoV 3. SARS-CoV SARS-CoV 5 SARS-CoV 3 (a1) 12

13 (a2) (b1) 13

14 (b2) (c1) 14

15 (c2) (d1) 15

16 (d2) (e1) 16

17 (e2) 3 5 a b c d e rep S E 17

18 M N 1 SARS-CoV 2 SARS-CoV rep S M N E IBV 1 TGV SARS-CoV rep S E M N E IBV TGV SARS-CoV E M SARS-CoV M IBV rep S N 5 SARS-CoV SARS-CoV IBV TGV E M SARS-CoV SARS-CoV IBV TGV IBV E M 1 P. A. Rota et al. (2003) Characterization of a Novel Coronavirus Associated with Severe Acute Respiratory Syndrome. Published online May 1, 2003; /science

19 (Science Express Research Articles) 2 S. M. Poutanen et al. (2003) Identification of Severe Acute Respiratory Syndrome in Canada. N. Engl. J. Med. Available April 17 at 3 T. G. Ksiazek, et al. (2003) A Novel Coronavirus Associated with Severe Acute Respiratory Syndrome N. Engl. J. Med. 348(20): Thompson,J.D., Gibson,T.J., Plewniak,F., Jeanmougin,F. and Higgins,D.G. (1997) The ClustalX windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools. Nucleic Acids Research, 24: Tree-Explore program was downloaded from -u.ac.jp/te/te_man.html. 19

270 2

270 2 270 ISSN 0255-6162 GPN 2006900031 270 92 6 20 161-2 0226531318 http://www.nlfd.gov.tw Severe Acute Respiratory Syndrome SARS 1 270 2 270 3 270 4 270 SARS Complete Genome Length (bp) GenBank Notation BCCA

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