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1 生 命 科 学 领 域 常 用 资 源 巩 玥 联 系 方 式 :

2 提 纲 一 生 命 科 学 领 域 重 要 文 献 数 据 库 资 源 介 绍 二 生 命 科 学 领 域 重 要 信 息 资 源 获 取

3 一 生 命 科 学 领 域 的 重 要 数 据 库 资 源 介 绍

4 1.Web of Science Quality 质 量 Diversity 广 度 Depth 深 度 Unique Data 独 特 的 数 据 Web of science 只 收 录 高 质 量 的 学 术 期 刊 质 量 广 度 深 度 与 100 年 来 的 学 术 引 文 回 溯 数 据 构 成 了 其 数 据 的 独 特 性, 揭 示 概 念 与 技 术 的 发 展 过 程

5

6 期 刊 引 用 报 告 JCR 以 定 量 的 方 式 了 解 全 球 的 学 术 期 刊 在 本 学 术 期 刊 相 应 领 域 中 的 影 响 力 描 述 指 标 : 影 响 因 子 总 被 引 次 数 刊 载 论 文 综 述 被 引 半 衰 期 或 期 刊 名 称 采 用 视 图 页 脚 填 写 课 件 名 称

7 基 本 科 学 指 标 ESI: 基 于 22 个 学 科 的 全 球 总 影 响 力 ( 总 被 引 次 数 ) 分 析, 筛 选 出 进 入 全 球 前 1% 的 科 学 家 研 究 机 构 以 及 进 入 全 球 前 50% 的 国 家 和 学 术 期 刊 描 述 指 标 : 文 献 量 篇 均 被 引 次 数 总 被 引 次 数 高 应 先 论 文 数 揭 示 不 同 国 家 机 构 学 科 发 展 优 势 比 较 采 用 视 图 页 脚 填 写 课 件 名 称

8 采 用 视 图 页 脚 填 写 课 件 名 称

9 可 以 从 11 个 角 度 深 入 分 析 11 个 角 度 的 深 入 分 析 : 作 者 出 版 年 机 构 名 称 来 源 出 版 物 学 科 领 域 基 金 资 助 机 构 授 权 号 国 家 与 地 区 文 献 类 型 文 献 语 种 会 议 标 题

10 作 者 : - 发 现 该 领 域 的 高 产 出 研 究 人 员 - 有 利 于 机 构 的 人 才 招 聘 - 选 择 小 同 行 审 稿 专 家 - 选 择 潜 在 的 合 作 者 保 存 本 地.txt 文 件, 右 键 用 Excel 格 式 打 开 文 档 并 作 图 机 构 - 发 现 该 领 域 高 产 出 的 大 学 及 研 究 机 构 - 有 利 于 机 构 间 的 合 作 - 发 现 深 造 的 研 究 机 构

11 基 金 资 助 机 构 : - 寻 求 基 金 资 助 来 源 - 发 现 本 课 题 基 金 资 助 的 机 构 - 概 览 基 金 资 助 的 论 文 产 出

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13 同 行 作 者 都 在 看 的 参 考 文 献 非 常 重 要, 应 该 重 点 阅 读

14 引 证 关 系 图 - 将 引 用 关 系 可 视 化

15 可 以 保 存 检 索 历 史 在 服 务 器 或 本 地 计 算 机 上 可 以 订 制 定 题 服 务

16 2. PubMed pubmed.gov PubMed 系 统 是 由 NLM 的 国 家 生 物 技 术 信 息 中 心 (National Center for Biotechnology Information,NCBI) 开 发 的 用 于 检 索 MEDLINE PreMEDLINE 数 据 库 的 网 上 检 索 系 统 从 1997 年 6 月 起,PubMed 在 网 上 免 费 向 用 户 开 放 特 点 : 收 录 范 围 广 泛 ( 生 物 医 学 领 域 ) 更 新 速 度 快 主 题 加 工 规 范 检 索 系 统 完 备 链 接 广 泛

17 PubMed 工 具 : Journal Database- 输 入 期 刊 刊 名 ISSN 或 Medline 刊 名 缩 写 查 询 期 刊 出 版 情 况 MeSH Database- 检 索 或 浏 览 Mesh 词 表 Single Citation Matcher- 查 找 特 定 刊 名 卷 期 作 者 篇 名 的 文 献 Batch Citation Matcher- 查 找 特 定 文 献, 输 入 刊 名 年 代 卷 期 起 始 页 作 者 名 关 键 词 等 LinkOut- 提 供 NCBI 之 外 的 网 络 资 源, 包 括 国 外 图 书 馆 馆 藏 目 录 数 据 库 等 个 性 化 服 务 (My NCBI)- 免 费 注 册

18 PMC 是 美 国 国 立 卫 生 研 究 院 提 供 的 一 项 服 务, 存 档 生 物 医 学, 生 命 科 学 科 研 文 献,PMC 获 得 NLM(National Library of Medicine) 的 授 权, 收 录 存 档 生 物 / 医 学 文 献, 以 电 子 副 本 的 形 式 储 存 PMC 与 2000 年 2 月 份 启 动, 目 前 由 NCBI(NLM s National Center for Biotechnology Information ) 负 责 开 发 与 维 护

19 3.CSHL 美 国 冷 泉 港 实 验 室 Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) 是 生 命 科 学 领 域 国 际 著 名 的 研 究 机 构, 也 是 国 际 生 命 科 学 的 会 议 中 心 与 培 训 基 地 名 列 世 界 上 影 响 最 大 的 十 大 研 究 学 院 榜 首, 被 称 为 世 界 生 命 科 学 的 圣 地 与 分 子 生 物 学 的 摇 篮 CSHL 负 责 人 沃 森 是 DNA 双 螺 旋 结 构 图 的 发 现 者 之 一, 诺 贝 尔 奖 得 主, 也 是 国 际 人 类 基 因 组 计 划 的 倡 导 者 和 实 施 者

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21 美 国 冷 泉 港 实 验 室 出 版 社 Cold Spring Harbor Laboratory Press 的 期 刊 具 有 很 高 的 影 响 因 子, 是 生 物 领 域 的 研 究 人 员 不 可 或 缺 的 研 究 参 考 资 料 1 Genes & Development 基 因 与 发 展 2 Genome Research 基 因 组 研 究 3 Learning & Memory 学 习 与 记 忆 4 RNA 核 糖 核 酸 5 Perspectives in Biology 生 物 学 进 展 6 Perspectives in Medicine 医 学 进 展 7 CSH Protocols 冷 泉 港 实 验 室 实 验 方 案 指 南

22 4.BioMed Central BioMed Central( 以 下 简 称 BMC) 是 生 物 医 学 领 域 的 一 家 独 立 的 新 型 出 版 社, 以 出 版 网 络 版 期 刊 为 主, 目 前 出 版 237 种 生 物 学 和 医 学 领 域 的 期 刊, 少 量 期 刊 同 时 出 版 印 刷 版 BMC 出 版 社 在 BMC 网 站 免 费 为 读 者 提 供 信 息 服 务, 其 出 版 的 网 络 版 期 刊 可 供 世 界 各 国 的 读 者 免 费 检 索 阅 读 和 下 载 全 文 Genome Biology 影 响 因 子 最 高 (10.810) BMC 出 版 的 期 刊 学 科 范 围 涵 盖 了 生 物 学 和 医 学 的 所 有 主 要 领 域, 包 括 : 麻 醉 学 生 物 化 学 生 物 信 息 学 生 物 技 术 等 57 个 分 支 学 科

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24 5.Faculty of 1000 Faculty of 1000 是 由 BioMed Central 出 版 的 新 型 在 线 研 究 辅 助 工 具, 由 超 过 4000d 位 专 家 学 者 评 议, 提 供 目 前 世 界 上 最 重 要 的 生 物 和 医 学 论 文 信 息 及 研 究 趋 势 Faculty of 1000 分 为 生 物 和 医 学 两 部 分, 收 录 的 是 顶 级 专 家 或 临 床 研 究 人 员 推 荐 的 文 章, 并 附 有 推 荐 评 述 按 研 究 领 域 分 为 44 类, 生 物 24 类, 医 学 20 类

25 主 页 F1000 Prime 获 取 最 新 同 行 评 议 Recommendations 论 文 评 价 ( 订 购 ) -Rankings 排 名 ( 免 费 ) -F1000 Prime Reviews 同 行 评 议 报 告 ( 免 费 ) F1000 支 持 的 工 作 空 间, 帮 助 科 研 人 员 收 集 整 理 文 章 写 作 投 稿 以 及 共 享 生 命 科 学 的 开 放 获 取 数 据 库

26 6.PLOS 公 共 科 学 图 书 馆 ( the Public Library of Science, PLOS) 创 立 于 2000 年 10 月, 由 众 多 诺 贝 尔 奖 得 主 和 慈 善 机 构 支 持 的 非 赢 利 性 学 术 组 织, 旨 在 推 广 世 界 各 地 的 科 学 和 医 学 领 域 的 最 新 研 究 成 果 PLoS 出 版 了 7 种 生 命 科 学 与 医 学 领 域 的 开 放 获 取 期 刊, 可 以 免 费 获 取 全 文, 比 较 具 有 影 响 力 Plos 系 列 的 期 刊 目 前 都 已 被 SCI 收 录 PLoS 出 版 7 种 期 刊 : PLoS Biology PLoS Medicine PLoS Computational Biology PLoS Pathogens PLoS Genetics PLoS ONE PLoS Neglected Tropical Diseases

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28 7.Annual Reviews Annual Reviews 系 列 期 刊 涉 及 生 物 学 医 学 物 理 学 和 社 会 科 学 领 域, 通 过 各 学 科 领 域 权 威 科 学 家 撰 写 的 综 述, 回 顾 本 学 科 最 前 沿 的 进 展, 为 科 学 研 究 提 供 方 向 性 指 导 Annual Reviews 系 列 期 刊 的 影 响 因 子 很 高, 几 乎 所 有 期 刊 在 其 相 应 领 域 均 排 名 前 十 位

29 生 命 科 学 领 域 26 种 期 刊

30 8. 学 协 会 期 刊 American Institute of Biological Sciences(AIBS): 美 国 生 物 科 学 研 究 所,1 种 刊 American Society for Microbiology Journal Online(ASM) : 美 国 微 生 物 学 会,11 种 刊 American Society of Agricultural and Biological Engineers (ASABE) : 美 国 农 业 生 物 工 程 师 学 会,5 种 刊 American Society for biochemistry and molecular biology : 美 国 生 化 与 分 子 学 会,3 种 刊 American Society of Nutrition: 美 国 营 养 学 会 American Society of Plant Biologists (ASPB) : 美 国 植 物 生 物 学 家 学 会 Botanical Society of America: 美 国 植 物 学 会 Genetics Society of America (GSA): 美 国 遗 传 学 学 会 ( 会 议 预 报, 项 目 资 助 项 目 信 息 ) Royal Society of Medicine (RSM): 英 国 皇 家 药 学 会

31 9. 其 他 重 要 数 据 库 Springer Elsevier OUP Science PNAS ISI-DII PQDT-B/ PQDT 全 文 CNKI

32 二 生 命 科 学 领 域 重 要 信 息 资 源 获 取

33 1. 文 献 信 息 Journal article 了 解 国 内 外 最 新 进 展, 实 验 技 术 与 方 法 Review 了 解 某 一 领 域 的 发 展 概 貌 研 究 背 景 Meeting/proceedings 了 解 最 新 进 展 Patent 了 解 最 新 技 术 Protocol 了 解 实 验 操 作 方 法

34 2. 核 酸 信 息 获 取 主 要 来 源 : 美 国 生 物 技 术 信 息 中 心 : GenBank 欧 洲 分 子 生 物 学 实 验 室 : EMBL-Bank GenBank USA 日 本 遗 传 研 究 所 : DDBJ DDBJ Japan EMBL Europe 三 个 数 据 库 每 天 交 换 最 新 数 据, 数 据 基 本 一 致, 仅 在 格 式 上 有 所 不 同

35 3. 蛋 白 质 信 息 获 取 主 要 来 源 美 国 生 物 医 学 基 金 会 :PIR Geneva 大 学 和 欧 洲 生 物 信 息 学 研 究 所 :SWISS-PROT 计 算 机 注 释 的 蛋 白 质 数 据 库 :TrEMBL 欧 洲 生 物 信 息 学 研 究 所 : UniProt TrEMBL PIR Uniprot SWISSPROT

36 4. 生 物 大 分 子 结 构 信 息 获 取 美 国 Brookhaven 实 验 室 : PDB(Protein Data Bank) 美 国 生 物 技 术 信 息 中 心 : MMDB(Molecular Modeling Database)

37 5. 模 式 生 物 基 因 组 信 息 获 取 酵 母 基 因 组 拟 南 芥 基 因 组 曲 霉 基 因 组 四 膜 虫 基 因 组 玉 米 基 因 组 水 稻 基 因 组 人 类 基 因 组 老 鼠 基 因 组 茄 科 基 因 组 斑 马 鱼 基 因 组 果 蝇 基 因 组

38 6. 生 物 论 坛 / 博 客

39 国 外 较 好 的 博 客, 会 有 相 关 人 员 将 自 己 的 文 章 放 在 上 面

40 可 以 按 学 科 时 间 进 行 相 关 浏 览, 部 分 提 供 PDF 全 文 下 载

41

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43 7. 分 析 工 具 ExPASy(Expert Protein Analysis System) 日 内 瓦 大 学 分 子 生 物 学 服 务 站, 提 供 与 蛋 白 有 关 的 各 种 在 线 工 具

44 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool) 对 一 条 或 多 条 序 列 在 一 个 或 多 个 核 酸 或 蛋 白 序 列 库 中 进 行 比 对

45 STRING(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) 检 索 蛋 白 质 或 基 因 互 作 的 工 具

46 8. 基 金 信 息 优 点 : 国 内 外 同 行 正 在 做 或 将 要 做 的 内 容 国 内 外 重 点 机 构 将 要 在 哪 些 研 究 领 域 进 行 相 关 资 助 国 内 外 同 行 接 受 资 助 后 有 哪 些 科 研 产 出 缺 点 : 只 能 了 解 到 项 目 或 资 助 的 摘 要 信 息 类 别 :Award/grant 已 经 资 助, Funding 将 要 资 助 常 用 的 基 金 信 息 有 :NSF,NIH,ARS,DOE 及 其 他 国 家 科 学 基 金 关 注 重 点 内 容 : 资 助 目 标 研 究 方 法 资 助 力 度 首 席 研 究 员 及 合 作 者, 科 研 产 出 情 况 美 国 :

47 8.1 美 国 国 家 科 学 基 金 立 项 进 展 资 助 情 况

48 8.2 美 国 国 立 卫 生 研 究 院 (NIH) 可 用 多 个 字 段 检 索, 关 键 词, 研 究 人 员, 机 构 等

49 8.3 美 国 农 业 部 农 业 研 究 中 心 (ARS) 美 国 能 源 部 (DOE)

50 项 目 检 索 列 表 不 可 拷 贝, 只 能 截 屏 国 家 基 金 委 项 目 主 题 词

51 8.5-2 科 学 网 科 学 网 上 可 检 索 基 金 委 的 项 目, 可 以 复 制, 不 能 批 量 下 载

52

53 8.6 科 技 部 ( 重 大 专 项 等 )

54 8.7 加 拿 大 卫 生 研 究 院 (CIHR) 可 以 检 索 或 浏 览 相 关 项 目

55 8.8 德 国 科 学 基 金 (DFG) 检 索 相 关 项 目

56 8.9 英 国 生 物 技 术 与 生 物 学 研 究 理 事 会 基 金

57 其 他 : Web of science 检 索 结 果 分 析 基 金 资 助 机 构 名 称 Google 查 找 地 址 基 金 网 站 上 查 找 funding, award,grant,research opportunities 等 CSA--COS Funding Opportunities 科 研 人 员 个 人 主 页 projects, 了 解 在 研 项 目 情 况

58 9. 重 要 研 究 机 构 德 国 马 普 学 会 英 国 John innes Center 美 国 国 立 生 物 技 术 中 心 冷 泉 港 实 验 室 欧 洲 生 物 信 息 研 究 所 新 加 坡 生 物 信 息 中 心 大 分 子 生 物 学 Top 国 家 : 美 国 德 国 英 国 荷 兰 日 本 加 拿 大

59 9.1 德 国 马 普 马 克 斯 普 朗 克 科 学 促 进 学 会 (International Max Planck Research School) 是 德 国 政 府 资 助 的 全 国 性 学 术 机 构 其 前 身 是 指 成 立 于 1911 年 的 威 廉 皇 家 学 会 目 前, 该 学 会 下 设 生 物 和 医 学 部 化 学 物 理 和 技 术 部 以 及 人 文 社 会 科 学 部, 拥 有 80 个 研 究 所 马 普 学 会 是 一 个 独 立 的 非 盈 利 性 研 究 组 织 主 要 任 务 是 支 持 自 然 科 学 生 命 科 学 和 人 文 科 学 和 社 会 科 学 等 领 域 的 基 础 研 究, 支 持 开 辟 新 的 研 究 领 域, 与 高 等 院 校 合 作 并 向 其 提 供 大 型 科 研 仪 器 学 术 带 头 人 可 以 自 主 选 择 研 究 课 题 开 展 研 究 工 作

60 9.2 英 国 John Innes Centre John Innes Centre 是 植 物 和 微 生 物 科 学 领 域 顶 尖 的 研 究 所

61 9.3 美 国 国 立 生 物 技 术 中 心 (NCBI) 美 国 国 立 医 学 图 书 馆 (NLM) 于 1988 年 11 月 4 日 建 立 国 家 生 物 技 术 信 息 中 心 (National Center of Biotechnology Information, 简 称 NCBI) 该 中 心 的 主 要 任 务 为 : 为 储 存 和 分 析 分 子 生 物 学 生 物 化 学 遗 传 学 知 识 创 建 自 动 化 系 统 ; 从 事 研 究 基 于 计 算 机 的 信 息 处 理 过 程 的 高 级 方 法, 用 于 分 析 生 物 学 上 重 要 的 分 子 和 化 合 物 的 结 构 与 功 能 ; 促 进 生 物 学 研 究 人 员 和 医 护 人 员 应 用 数 据 库 和 软 件 ; 努 力 协 作 以 获 取 世 界 范 围 内 的 生 物 技 术 信 息

62 9.4 冷 泉 港 实 验 室 位 于 美 国 纽 约 长 岛 冷 泉 港, 建 于 1890 年, 以 定 量 生 物 学 而 著 称 CSHL 负 责 人 沃 森 先 生 是 DNA 双 螺 旋 结 构 图 的 发 现 者 之 一, 诺 贝 尔 奖 得 主, 也 是 国 际 人 类 基 因 组 计 划 的 倡 导 者 和 实 施 者 冷 泉 港 实 验 室 为 一 家 非 政 府 非 盈 利 的 科 研 与 教 育 机 构 在 美 国 科 学 院 院 士 英 国 皇 家 学 会 会 员 Bruce Stillman 博 士 的 领 导 下, 大 约 330 名 科 学 家 在 这 里 就 癌 症 神 经 生 物 学 植 物 遗 传 学 和 生 物 信 息 学 进 行 创 造 性 的 研 究 冷 泉 港 实 验 室 是 美 国 国 家 癌 症 研 究 所 (National Cancer Institute) 在 美 国 指 定 的 八 所 基 础 研 究 中 心 之 一, 也 是 其 中 唯 一 横 跨 三 个 州 份 的 基 础 研 究 中 心

63 9.5 欧 洲 生 物 信 息 研 究 所 (EMBL) European Bioinformatics Institute

64 9.6 新 加 坡 生 物 信 息 中 心 National Bioinformatics centre

65 谢 谢! 生 命 科 学 领 域 常 用 资 源 介 绍 巩 玥 O c t

18 上 报 该 学 期 新 生 数 据 至 阳 光 平 台 第 一 学 期 第 四 周 至 第 六 周 19 督 促 学 习 中 心 提 交 新 增 专 业 申 请 第 一 学 期 第 四 周 至 第 八 周 20 编 制 全 国 网 络 统 考 十 二 月 批 次 考 前 模 拟 题 第 一 学

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