Primer Express v3.0 中文操作手冊
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- 算律 伏
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1 Primer Express v3.0 Primers and Probe Design For Real-Time PCR
2 Primers/Probes Design Guideline TaqMan Probe Primer Probe Primer 離, PCR bp G/C % % 列 4 G Tm : (Quantification assay) (Allelic Discrimination assay) Probe 度 : 13~25 bases (TaqMan MGB probe) 13~30 bases (TaqMan probe) 連 6 A 列 5 列不 G ( FAM-dye 5 列 不 G) CGstrandprobe b 3 4 列裡 3 G (GGG-MGB-3 or GGAG-MGB-3 ) a probe 2 CC di-nucleotides a a: TaqMan MGB probe b: 參數 Tm : Primer 度 : 20 bases (Optimal) 3 列裡不 2 C+G
3 Primers & Probes for Quantification Automatically Design Primer Express 3.0 File New TaqMan MGB Quantification TaqMan Quantification OK Tools Add DNA File 列 Add 列 Sequence Tab Copy & Paste 列 * Primer Express Software.dan,.txt,.ab1,.abi, 列 ( 若 列 database download 來, 列 料 )
4 Double Strand, double stranded DNA sequence Tools 1. Exclude: 不 列 利 Exclude Selected Bases 列 - 不 列 Exclude 見
5 2. Junction: 列 junction 利 Junction - juction ( 2 bases) Junction 見 來 3. Parameters Tab Primer/Probe Tm Primers/Probe
6 Sequence TabTools Find Primers/Probes Primers/Probe pairs Primer Express Candidate Primers & Probe pairs search 50 列 Primers / Probes Tab Location 說 primers & probes 列 數 Sequence Tab Primers / Probes Tab Primers/Probe: Probe 藍 Forward Primer Reverse Primer(* 不 )
7 Primers / Probes TabPrimers/Probe 列 來 2 primer/ probe design guidelinemgb Probe Parameters Tab C G 列 參數 primer/ probe set 行 File Save As primer/ probe set 利 Export Order Info 50 Primers/Probes Export Primers/Probes List 兩 都.txt Excel
8 Manually Design Primer/Probe Primer/Probe Quantification Document 列 ( 參 3 ) 1. Probe : Sequence Tab Probe 列 highlight 來 ( 25 bases 度 度 列 ) 利 Edit Copy (Ctrl+C) 列 Tools Primer Probe Test Tool document type ( TaqMan MGB Quantification TaqMan Quantification ) Parameter Default 利 Paste (Ctrl+V) 列 Probe 1 欄 列 Tm, %GC 度 : probe 列不 G 列裡 C 數 G 若 Tm (68to 70) Probe 1 欄 不 列 Tm, %GC 度 Probe ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 Probe 列
9 Probe 列 Sequence Tab Probe 列 highlight 來 利 Edit Annotate Probe probe 列 來 probe 綠 利 Tools Find Primers/Probes Probe Forward / Reverse Primers 若 Primers 行 Forward / Reverse Primers
10 2. Forward Primer : Sequence Tab Primer 列 highlight 來 ( 25 bases 度 切 Probe 列 ) 利 Edit Copy (Ctrl+C) 列 Tools Primer Probe Test Tool 利 Paste (Ctrl+V) 列 Fwd Primer 欄 列 Tm, %GC 度 Forward Primer Tm Tm 不 Fwd Primer 不 列 Tm, %GC 度 Primer ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 列 Fwd Primer 列 Sequence Tab 列 highlight 來 利 Forward Primer 來 Fwd Primer 藍
11 3. Reverse Primer Sequence Tab Reverse 列 highlight 來 ( 25 bases 度 切 Probe 列 ) 利 Edit Copy Complement 列 Tools Primer Probe Test Tool Rev Primer 欄 Reverse Primer Tm Tm 不 Rev Primer 不 列 Tm, %GC 度 Primer ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 列 Rev Primer 列 Sequence Tab 列 highlight 來 利 Reverse Primer 來 Rev Primer
12 primer/ probe set 利 Copy & Paste text save 來 來參 料 document 行 File Save As
13 SYBR Green I Primer for Quantification Automatically Design Primer Express 3.0 File New TaqMan MGB Quantification TaqMan Quantification OK Tools Add DNA File 列 Add 列 Sequence Tab Copy & Paste 列 * Primer Express Software.dan,.txt,.ab1,.abi, 列 ( 若 列 database download 來, 列 料 )
14 Double Strand, double stranded DNA sequence Tools 1. Exclude: 不 列 利 Exclude Selected Bases 列 - 不 列 Exclude 見
15 2. Junction: 列 junction 利 Junction - juction ( 2 bases) Junction 見 來 3. Parameters Tab Primer Tm Primers
16 Sequence TabTools Find Primers/Probes Primers/Probe pairs Primer Express Candidate Primers & Probe pairs search 50 列 Primers / Probes Tab 若 行 SYBR Green primer 不 probe 列 參 primer 列 Location 說 primers & probes 列 數 Sequence Tab Primers / Probes Tab Primers/Probe: Probe 藍 Forward Primer Reverse Primer(* 不 )
17 Primers / Probes Tab Primers/Probe 列 來 2 primer/ probe design guideline * SYBR Green primer primer dimer - Primers / Probes Tab primer set 來 Primer Secondary Structure Hairpin, Self Dimers Cross Dimers 數 GC 例
18 primers set 行 File Save As primers set 利 Export Order Info 50 Primers/Probes Export Primers/Probes List 兩 都.txt Excel
19 Manually Design Primer Primer Quantification Document 列 ( 參 13 ) 1. Forward Primer : Sequence Tab Primer 列 highlight 來 ( 25 bases 度 度 列 ) 利 Edit Copy (Ctrl+C) 列 Tools Primer Probe Test Tool document type ( TaqMan MGB Quantification TaqMan Quantification ) Parameter Default 利 Paste (Ctrl+V) 列 Fwd Primer 欄 列 Tm, %GC 度 Forward Primer Tm Tm 不 Fwd Primer 不 列 Tm, %GC 度 Primer ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 列
20 2. Reverse Primer : Sequence Tab Reverse 列 highlight 來 ( 25 bases 度 度 列 ) 利 Edit Copy Complement 列 Tools Primer Probe Test Tool Rev Primer 欄 Reverse Primer Tm Tm 不 Rev Primer 不 列 Tm, %GC 度 Primer ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 列
21 3. SYBR Green primer primer dimer - Primer Probe Test Tool primer set Show Secondary Stucture 來 Primers Hairpin, Self Dimers Cross Dimers 數 GC 例 primer Fwd Primer 列 Sequence Tab 列 highlight 來 利 Forward Primer 來 Fwd Primer 藍
22 Rev Primer 列 Sequence Tab 列 highlight 來 利 Reverse Primer 來 Rev Primer primer/ probe set 利 Copy & Paste text save 來 來參 料 document 行 File Save As
23 Primers & Probes for Allelic Discrimination Automatically Design Primer Express 3.0 File New TaqMan MGB Allelic Discrimination TaqMan Allelic Discrimination OK TaqMan MGB probe 更 Tools Add DNA File 列 Add 列 Sequence Tab Copy & Paste 列 * Primer Express Software.dan,.txt,.ab1,.abi, 列 ( 若 列 database download 來, 列 料 )
24 SNP SNP highlightedit Annotate SNP Target SNP 異 (variant) 例 528 G/A SNP G A R OKSNP r
25 Tools Find Primers/Probes Primers/Probes pairs Primer Express Candidate Primers & Probes pairs search 50 列 Primers / Probes Tab Location 說 primers & probes 列 數 Sequence Tab Primers / Probes Tab Primers/Probes: Probe 1 綠 Probe 2 (2 Probe 列 綠 ) 藍 Forward Primer Reverse Primer(* 不 )
26 Primers / Probes TabPrimers/Probe 列 來 2 primer/ probe design guidelinemgb Probe Parameters Tab C G 列 參數 primer/ probe set 行 File Save As primer/ probe set 利 Export Order Info 50 Primers/Probes Export Primers/Probes List 兩 都.txt Excel
27 Manually Design Primer/Probe Primer/Probe Allelic Discrimination Document 列 ( 參 23 ) 1. Probe for Allele 1: Sequence Tab SNP highlight 來 Edit Annotate SNP Target SNP 異 ( 參 24 ) Probe1 列 highlight 來 ( 13~25 bases 度 ) 利 Edit Copy with Allele 1 (Ctrl+Shift+W) 列 Tools Primer Probe Test Tool document type ( TaqMan MGB Allelic Discrimination TaqMan Allelic Discrimination ) Parameter Default 利 Paste (Ctrl+V) 列 Probe1 欄 Allele 1 variant base ( 例 g ) 列 Tm, %GC 度 : probe 列不 G 列裡 C 數 G
28 若 Tm (65to 67) Probe 1 欄 不 列 Tm, %GC 度 Probe ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 Probe 列 SNP SNP Probe 列 3 2 base 不 兩 base
29 2. Probe for Allele 2: Sequence Tab Probe2 列 highlight 來 ( 13~25 bases 度 ) 利 Edit Copy with Allele 2 (Ctrl+Shift+M) 列 Tools Primer Probe Test Tool 利 Paste (Ctrl+V) 列 Probe2 欄 Allele 2 variant base ( 例 a ) 列 Tm, %GC 度 若 Tm (65to 67) Probe 1 欄 不 列 Tm, %GC 度 Probe ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 Probe 列 probe1 probe2 Tm 異不 1
30 3. Forward Primer : Sequence Tab Primer 列 highlight 來 ( 25 bases 度 切 Probe 列 ) 利 Edit Copy (Ctrl+C) 列 Tools Primer Probe Test Tool 利 Paste (Ctrl+V) 列 Fwd Primer 欄 列 Tm, %GC 度 Forward Primer Tm Tm 不 Fwd Primer 不 列 Tm, %GC 度 Primer ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 列
31 4. Reverse Primer : Sequence Tab Reverse 列 highlight 來 ( 25 bases 度 切 Probe 列 ) 利 Edit Copy Complement 列 Tools Primer Probe Test Tool Rev Primer 欄 Reverse Primer Tm Tm 不 Rev Primer 不 列 Tm, %GC 度 Primer ( 參 primer/ probe design guideline) 若 Trim 列 留 列
32 primer/ probe set 利 Copy & Paste text save 來 來參 料 document 行 File Save As : TWSupport@appliedbiosystems.com
台灣經濟新報資料庫
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依據教育部八十九年 月 日臺(八九)技(二)字第 號函
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個人提供土地與建設公司合建分屋並出售合建分得之房屋，核屬營業稅法規定應課徵營業稅之範圍，自本函發布日起，經建築主管機關核發建造執照之合建分屋案件，附符合說明二之規定者外，均應辦理營業登記，課徵營業稅及營利事業所得稅
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地方公共服務績效比較評量之探討—標竿學習策略的觀點
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《摘要》
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九十三年第三期檔案管理工作研習營學員建議事項答覆情形彙整表
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臺灣地區的警察教育現況與展望
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國立自然科學博物館館訊第263期
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吃寒天真的能減肥嗎
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台南縣全民學區數位學習課程進階班—PhotoImpact 10
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費協會第152次會議
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第五章 實例個案
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國立中山大學學位論文典藏.PDF
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國立陽明大學輻射防護計畫書
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十四、特殊需求的嬰兒
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大陸黨報集團化發展之研究
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認識[第2型]糖尿病
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龍華科技大學
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1－2岁宝宝的游戏和活动指南
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序論
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九十三年度西醫基層醫療給付費用總額及其分配
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第一章 緒論
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高苑技術學院八十七學年度二年制技術系
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第一章 概要
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